“草到安國方成藥，藥經(jīng)祁州始生香”，祁州（今安國）千百年來便被冠以“千年藥都”和“天下第一藥市”的美譽。
故事發(fā)生在明末清初，劉家乃祁州最大的藥商，劉老爺為祁州北大會的會長，在祁州藥商界有很高的名望。隨著祁州藥市規(guī)模的不斷壯大，同為祁州大藥商的趙家開始對劉家充滿了嫉恨。
劉文元，劉家獨子，安客堂的堂主，為人剛正不阿，自小受高人指點，一邊學醫(yī)，一邊跟在父親身邊學習醫(yī)藥經(jīng)營。偶然的機會與京城來的戲班名角白玉竹相識，兩人的相愛遭到了趙家二公子趙天麻的仇恨。為了橫刀奪愛，也為了讓劉家在祁州的生意衰落，從而把劉文元推下安客堂堂主的位置，趙家使出種種手段陷害劉家，于是一場明爭暗斗的官商之爭及愛情故事在千年藥都由此展開。